Viroma de ssDNA e agentes subvirais em plantas alimentícias não convencionais e medicinais

Abstract

Plantas alimentícias não convencionais (PANC) e plantas medicinais desempenham papéis relevantes na segurança alimentar, na medicina tradicional e na manutenção da biodiversidade, porém permanecem pouco exploradas como hospedeiras de vírus de plantas. Neste estudo foi realizado um levantamento da diversidade de vírus de DNA fita simples (ssDNA) associados a esses grupos vegetais utilizando sequenciamento de alto desempenho (HTS). Foram analisadas 142 amostras foliares coletadas em todas as regiões do Brasil. Após extração de DNA total, amplificação por círculo rolante (RCA) e sequenciamento na plataforma Illumina, a montagem de novo das reads gerou 86.818 contigs, dos quais 48 apresentaram similaridade com sequências virais. Entre estes, 42 contigs foram classificados como membros do gênero Begomovirus (família Geminiviridae), incluindo 23 correspondentes ao componente genômico DNA-A e 19 ao DNA-B. A análise de identidade nucleotídica revelou a presença de cinco espécies previamente descritas de begomovírus e sete sequências do componente DNA-A com identidade inferior a 91% em relação a sequências disponíveis no GenBank, compatíveis com prováveis novas espécies segundo os critérios taxonômicos do International Committee on Taxonomy of Viruses. Além dos begomovírus, foram identificadas sequências relacionadas a alphasatélites, gemycircularvírus e um membro da família Caulimoviridae. Destaca-se ainda a detecção de bean golden mosaic virusinfectando Euphorbia heterophylla, ampliando o espectro de hospedeiras conhecidas para essa espécie viral. Em conjunto, os resultados demonstram que PANC, plantas medicinais e espécies espontâneas podem abrigar uma diversidade relevante de vírus ssDNA, evidenciando o potencial desses grupos vegetais como reservatórios pouco explorados de diversidade viral em agroecossistemas.