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| Data de publicação | Data de defesa | Título | Autor(es) | Orientador(es) | Coorientador(es) |
| 22-ago-2019 | 28-fev-2019 | Análises da diversidade e estrutura genética de populações de Carollia perspicillata (Chiroptera, Phyllostomidae) em Unidades de Conservação do Cerrado | Cardoso, Tais de Menezes | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | Rodrigues, Fernando Pacheco |
| 15-set-2009 | 2008 | Assembléias de morcegos (Mammalia: Chiroptera) em áreas preservadas e degradadas do Cerrado do Distrito Federal | Oliveira, Hernani Fernandes Magalhães de | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 10-dez-2024 | 26-jul-2024 | Atividade de morcegos insetívoros em um gradiente urbano-natural do Cerrado de Brasília | Silva, Claysson Henrique De Aguiar | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 15-mai-2015 | 27-fev-2015 | Avaliação fisiológica de morcegos frugívoros neotropicais e estruturação da assembleia causado pela alteração de habitat no cerrado | Amaral, Thales Simioni | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | Pinheiro, Eliana de Cássia |
| 9-abr-2020 | 30-jul-2019 | Dieta de morcegos insetívoros urbanos sob uma abordagem DNA metabarcoding | Rocha, Igor Daniel Bueno | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 30-abr-2015 | 23-fev-2015 | Ecologia de moscas ectoparasitas (Diptera, Streblidae e Nycteribiidae) de morcegos (Mammalia, Chiroptera) em áreas de Cerrado do Brasil Central | Ramalho, Daniel de Figueiredo | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 1-dez-2021 | 31-ago-2021 | Fatores estruturantes, padrões espaço-temporais e novas interações na rede entre morcegos visitantes florais e plantas de uma savana Neotropical | Diniz, Ugo Mendes | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 8-mar-2022 | 24-nov-2021 | História da invasão do javali (Sus scrofa L.) no Brasil contada pela dispersão e morfologia, com cenários de manejo da espécie | Hegel, Carla Grasiele Zanin | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | Fornel, Rodrigo |
| 9-ago-2013 | 2013 | Importância da heterogeneidade de habitats na estruturação da diversidade α e β de morcegos Phyllostomidae no Cerrado | Fortunato, Danilo de Siqueira | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | Almeida Neto, Mário |
| 6-jun-2024 | 20-out-2023 | Influência da ecolocalização na variação morfométrica do crânio de morcegos frugívoros da família Phyllostomidae | Silveira, Maria Clara da | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 4-jul-2012 | 5-mar-2012 | Interação morcego-fruto : estado da arte no Brasil e um estudo da chuva de sementes por aves e morcegos em uma área do Cerrado em Brasília | Sette, Isadora de Miranda e Souza | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 30-jun-2020 | 28-jun-2019 | Is the response of insectivorous bats to vegetation cover scale – dependent? | Rodrigues, Camila Moniz Freire | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 26-ago-2024 | 8-dez-2023 | Jantar à luz de postes : morcegos urbanos forrageiam em áreas iluminadas? | Almeida, Ilanna Maria Holanda | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 7-mai-2020 | 31-jul-2019 | A luz artificial a noite em parques urbanos afeta os morcegos ou as presas de morcegos? | Reis, Lucas Damásio Evangelista | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 30-mar-2020 | 9-jul-2019 | A mesma pressão, diferentes reações : serviços ecossistêmicos realizados por morcegos sob risco no Brasil | Brasileiro, Lais Alves Moreira | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 17-mar-2022 | 27-ago-2021 | Morcegos frugívoros de Brasília | Lauretto, Lucas de Toledo | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 28-fev-2020 | 11-jun-2019 | Morcegos na beira da estrada : atividade, diversidade, forrageio e atropelamentos | Ramalho, Daniel de Figueiredo | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 20-nov-2017 | 4-jul-2017 | Novos métodos em Ecologia de Estradas : correção da heterogeneidade espacial na análise de agregação de atropelamentos de fauna e definição da suficiência amostral | Figueiredo, Almir Picanço de | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 27-jan-2017 | 5-jul-2016 | O hábito alimentar dos morcegos (Mammalia, Chiroptera) e sua relação com a diversidade viral | Teixeira, Paula Galvão | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | Melo, Fernando Lucas |
| 27-jun-2022 | 29-mar-2022 | Padrão de atividade e de ocupação do habitat de carnívoros no Parque Nacional da Chapada dos Veadeiros | Machado, Isadora Oliveira | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |