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Título : Estudos biológicos e moleculares de um isolado necrótico de bean yellow mosaic virus (BYMV), não transmitido por afídeos
Autor : Mello, Raquel Neves de
Orientador(es):: Costa, Cláudio Lúcio
Resende, Renato de Oliveira
Assunto:: Vírus - BYMV
Afídeos
Potyvirus
Fecha de publicación : 28-ene-2021
Citación : MELLO, Raquel Neves de. Estudos biológicos e moleculares de um isolado necrótico de bean yellow mosaic virus (BYMV), não transmitido por afídeos. 1996. xiv, 83 f. Dissertação (Mestrado em Ecologia)—Universidade de Brasília, Brasília, 1996.
Resumen : Bean yellow mosaic virus (BYMV) é uma espécie do gênero Potyvirus, da família Potyviridae. Esses vírus são transmitidos por afídeos de maneira não persistente, exigindo para tal a presença de duas proteínas codificadas pelo vírus: a proteína da capa (CP) e a proteinase “helper component” (HC-Pro). Mutações em alguns poucos blocos de aminoácidos nestas duas proteínas estão relacionadas com a perda da transmissão de potyvirus por afídeos. Mutações no “triplet” altamente conservado D/NAG, localizado na região N-terminal da CP, e nos blocos KITC e PTK, localizados respectivamente no N-terminal e no C-terminal de HC-Pro, foram associadas com esta perda. Uma estirpe necrótica de BYMV, denominada BYMVn, não foi transmitida por 15 diferentes espécies de afídeos. Ensaios de transmissão dependente, utilizando-se BCMV como vírus auxiliar, e com dez diferentes fontes de inóculo também foram negativos. Visando elucidar a base molecular da não transmissão de BYMVn, a porção Nterminal da CP foi caracterizada. RNA total de planta infectada com BYMVn foi extraído e utilizado como molde na obtenção de cDNA. Este último foi submetido à amplificação por PCR e o produto obtido (414pb da região N-terminal da CP) foi ligado ao plasmídio pGemT Vector. O clone obtido foi sequenciado, permitindo a leitura de 170 nucleotídeos da região 5’ e 208 da região 3’ do fragmento. O “triplet” NAG da CP mostrou-se conservado, não podendo ser associado a não transmissão de BYMVn por afídeos. Análise molecular subsequente de HC-Pro poderia mostrar se mutações nos blocos KITC e/ou PTK estariam, portanto, envolvidas na perda da capacidade de transmissão de BYMVn pelo inseto vetor. Como aproximadamente 40% da CP, representando a metade N-terminal, de BYMVn foi sequenciada, os valores de homologia encontrados devem representar as diferenças reais existentes entre a CP deste isolado e as dos demais já caracterizados. Diferenças variando de 18,3 à 29,6% de nucleotídeos e de 12,0 à 25,5% de aminoácidos demonstram que mesmo dentro de uma espécie de potyvirus, variações significativas nas seqüências de nucleotídeos e de aminoácidos podem ser encontradas, refletindo as diferenças biológicas observadas entre este e os demais isolados. A análise dos valores de identidade e similaridade da seqüência de aminoácidos entre BYMVn e os demais isolados demonstrou que o isolado necrótico BYMVn é mais relacionado com a estirpe S. 62 Estudos adicionais de western blot mostraram uma massa molecular da CP de BYMVn de cerca de 30 kDa, sendo que a proteína manteve sua reatividade sorológica. O perfil peptídico da CP, obtido através de digestão tríptica e HPLC, mostrou que esta técnica pode ser usada na diferenciação de espécies de potyvirus, mas não permite localizar diferenças menores na seqüência de aminoácidos, como as responsáveis pela transmissão por afídeos.
Abstract: Bean yellow mosaic virus is a virus species identified as a member of the genus Potyvirus within the Potyviridae family. These viruses are aphid transmitted in a nonpersistent manner. The transmission depends upon both virus encoded proteins: the coat protein (CP) and the heiper component proteinase (HC-Pro). Mutational studies in some of the amino acids domains demonstrated that both proteins are related with the loss of transmission of these viruses by aphids. Mutations on the highly conserved triplet D/NAG, located at the CP N-terminal, and on KITC and PTK boxes, located at HC-Pro N-terminal and C-terminal respectively, were associated with the lack of vector transmissibility. Fifteen different species of aphids were tested for the transmission of a BYMV necrotic strain, denoted BYMVn. None of them was able to transmit this virus strain. Dependent transmission assay, using BCMV as helper virus, was also negative. Ten different inocullum sources for virus acquisition by the aphid were also tested and no virus transmission was obtained. In order to elucidate the molecular basis of this non aphid-transmissibility of the viruses, part of the N-terminal of the BYMVn coat protein was sequenced. Total RNA was extracted from plants infected with BYMVn and used as template for cDNA synthesis. This cDNA was used as template for amplification by PCR and the product (414 bp from the CP N-terminal) was cloned in the pGemT Vector and sequenced. A nucleotide sequence of 170 bases from 5’ region and 208 base from 3’ region of that fragment was obtained The triplet NAG showed to be conserved in the BYMVn coat protein and it can not be associated to inability of the virus to be aphid transmitted. Further molecular analysis of the HC-Pro may show if mutations on KITC or PTK boxes are involved on the BYMVn transmissibility by aphids. Approximately 40% of N-terminal coat protein of BYMVn was sequenced. The similarity values found may correspond to the real difference between the BYMVn CP and the other previously isolates characterize. Differences ranging from 18,3 - 29,6% of nucleotides sequences, and 12 - 25,5% at amino acids levei demonstrate that even in the some species of potyvirus, significant variations in the nucleotides and amino acids sequences can be found and it can express the biological differences observed between BYMVn and the other BYMV isolates. Analysis of the amino acid similarities and identities between BYMVn and the other isolates demonstrated that the necrotic isolate is closer related to the S strain. 65 Additional western blot studies showed that CP of BYMVn has a molecular welght of about 30 kDa, showing no changes In its serologlcal reactivlty. The HPLC peptlde profile of tryptlc dlgest CP showed that this technlque can be used to separate spoclos wlthln tho potyvirus gonus, but it doos not allow us to locnlo smoll dlfferoncos In the amino acld sequence responslble for aphid transmission.
metadata.dc.description.unidade: Instituto de Ciências Biológicas (IB)
Descripción : Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, 1996.
metadata.dc.description.ppg: Programa de Pós-Graduação em Ecologia
Aparece en las colecciones: Teses, dissertações e produtos pós-doutorado

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