| DC Field | Value | Language |
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| dc.contributor.advisor | Rech Filho, Elíbio Leopoldo | - |
| dc.contributor.author | Lemos, Vinicius Nattan Silva | - |
| dc.date.accessioned | 2020-03-02T21:56:31Z | - |
| dc.date.available | 2020-03-02T21:56:31Z | - |
| dc.date.issued | 2020-03-02 | - |
| dc.date.submitted | 2019-07-29 | - |
| dc.identifier.citation | LEMOS, Vinicius Nattan Silva. Exploração in silico de dados de RNA-Seq de sementes de Elaeis guineensis, Jatropha curcas e Ricinus communis para a reconstrução de vias metabólicas de ácidos graxos e anotação de genes de interesse biotecnológico. 2019. 140 f., il. Dissertação (Mestrado em Tecnologias Química e Biológica)—Universidade de Brasília, Brasília, 2019. | pt_BR |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.unb.br/handle/10482/37020 | - |
| dc.description | Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Química, Programa de Pós-Graduação em Tecnologias Química e Biológica, 2019. | pt_BR |
| dc.description.abstract | Jatropha curcas (pinhão-manso), Ricinus communis (mamona) e Elaeis guineensis (dendê)
produzem ácidos graxos que podem ser utilizados como fonte renovável na matriz energética,
apresentando um grande potencial biotecnológico para as indústrias da área. Um melhor
conhecimento das vias metabólicas associadas com a síntese de ácidos graxos contribuirá
para a maximização da produção utilizando métodos de engenharia metabólica e biologia
sintética. O objetivo deste trabalho foi identificar transcritos relacionados com a síntese de
ácidos graxos e inferir a sua presença em vias metabólicas. Para isso, o RNA total de
sementes destas três espécies foi extraído e sequenciado utilizando a tecnologia Illumina
HiSeq 2500. Após a exclusão de reads de baixa qualidade, os transcritomas foram montados
utilizando seis programas diferentes. Os resultados obtidos foram filtrados com o programa
Evidential Gene para a obtenção de resultados robustos. Um banco de dados local com 250
proteínas associadas à 12 vias metabólicas de ácidos graxos de 10 plantas foi criado para a
identificação dos transcritos de interesse. Um total de 110, 110 e 109 proteínas únicas
relacionadas com a produção de óleo foram identificados, com 146, 146 e 148 ocorrências em
J. curcas, R. communis e E. guineensis respectivamente nas 12 vias metabólicas associadas a
ácidos graxos. O número esperado de ocorrências, de acordo com o KEGG, seria de 158, 162
e 159, respectivamente. A estratégia desenvolvida foi capaz de identificar cinco transcritos
que não haviam sido anotados nos genomas e na base de dados KEGG. A informação obtida
neste trabalho pode ser utilizada como material de referência para estudos de engenharia
metabólica e melhoramento da produção de ácidos graxos para propósitos industriais,
principalmente voltado a biocombustíveis e produção de fármacos. | pt_BR |
| dc.language.iso | Português | pt_BR |
| dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
| dc.title | Exploração in silico de dados de RNA-Seq de sementes de Elaeis guineensis, Jatropha curcas e Ricinus communis para a reconstrução de vias metabólicas de ácidos graxos e anotação de genes de interesse biotecnológico | pt_BR |
| dc.type | Dissertação | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Ácidos graxos | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Síntese de ácidos graxos | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Jatropha curcas | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Elaeis guineensis | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Ricinus communis | pt_BR |
| dc.rights.license | A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data. | pt_BR |
| dc.description.abstract1 | Jatropha curcas, Ricinus communis and Elaeis guineensis produce fatty acids that can be
used as a renewable source in the energy matrix, presenting a great biotechnological potential
for the industry. A better understanding of the metabolic pathways associated with fatty acid
synthesis will contribute to the maximization of production using metabolic engineering and
synthetic biology. The objective of this work was to identify transcripts related to the
synthesis of fatty acids and to infer their presence in metabolic pathways. For this, the total
seed RNA of these three species was extracted and sequenced using Illumina HiSeq 2500
technology. After exclusion of low-quality reads, the transcripts were assembled using six
different programs. The results obtained were filtered with the Evidential Gene program to
obtain robust results. A local database of 250 proteins associated with 12 metabolic pathways
of 10 plant fatty acids was created for the identification of the transcripts of interest. A total
of 110, 110 and 109 unique proteins related to the production of oil were identified, with 146,
146 and 148 occurrences in J. curcas, R. communis and E. guineensis respectively in the 12
metabolic pathways associated with fatty acids. The expected number of occurrences,
according to the KEGG, would be 158, 162 and 159, respectively. The strategy developed
was able to identify five transcripts that had not been annotated in the genomes and in the
KEGG database. The information obtained in this work can be used as reference material for
studies of metabolic engineering and improvement of the production of fatty acids for
industrial purposes, mainly focused on biofuels and drug production. | pt_BR |
| Appears in Collections: | Teses, dissertações e produtos pós-doutorado
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