Caracterização do tomato severe deformation virus, um novo begomovírus em tomateiro causando sintoma severo de deformação foliar

Abstract

Lavouras de tomateiro são frequentemente afetadas por doenças causadas por begomovírus, que podem causar sérios impactos na produção da cultura no Brasil. Os begomovírus apresentam alta diversidade genômica, evidenciada pelos inúmeros variantes já relatados. Uma amostra de tomateiro apresentando sintomas de clorose, forte deformação foliar e enrolamento do ápice foi encontrada em Cristalina, Goiás. A amostra foi coletada, a presença do vírus confirmada e o DNA genômico clonado, sendo identificado como um novo begomovírus. A sequência do genoma completo foi determinada e confirmada por sequenciamento Sanger, com o tamanho de 2.639 nucleotídeos para o DNA-A e 2.598 nucleotídeos para o DNA-B. Os dois segmentos do genoma foram comparados com as sequências de outros begomovírus mais próximos, revelando uma máxima identidade de 86,24% do DNA-A desse begomovírus com o tomato interveinal chlorosis virus 2 (ToICV2; acesso MK087038) e do DNA-B de 86,47% com o segmento B desse mesmo vírus (MK087039). Isso confirmou que o isolado pertence a uma potencial nova espécie, por apresentar uma identidade de nucleotídeos do DNA-A menor que 91%, segundo o critério taxonômico para distinção de espécies no gênero Begomovirus. A organização genômica do vírus é típica de um begomovírus bipartido do Novo Mundo. Em uma análise filogenética, o DNA-A do potencial novo begomovírus agrupou-se com o ToICV2 e o DNA-B com ToICV2, conforme esperado. Clones infecciosos do DNA-A e DNA-B foram gerados por Gibson Assembly e a capacidade de infecção foi avaliada via agroinoculação. Três cultivares de tomateiro foram inoculadas e 88 foram infectadas de um total de 101 plantas de tomateiro, distribuídas entre as cultivares Santa Clara (29/33), BRS Sena (25/32) e Compack (34/36). Os sintomas observados nas plantas infectadas foram similares aos observados em campo, incluindo clorose, forte deformação foliar e enrolamento do ápice, demonstrando a associação do vírus com a doença e concluindo os Postulados de Koch. Os resultados comprovam a presença de um novo begomovírus, cujo nome proposto é tomato severe deformation virus (TSDV) com o nome binomial Begomovirus solanumacutadeformationis. O TSDV foi encontrado em uma região onde já foi detectada a ocorrência dos begomovírus tomato mottle leaf curl virus, tomato severe rugose virus e tomato interveinal chlorosis virus-2 em tomateiro, evidenciando uma rica diversidade de espécies de begomovírus na região.