Campo DC | Valor | Idioma |
dc.contributor.advisor | Castro, Luiz Claudio Gonçalves de | - |
dc.contributor.author | Lima, Cristiane Jeyce Gomes | - |
dc.date.accessioned | 2021-07-06T00:31:15Z | - |
dc.date.available | 2021-07-06T00:31:15Z | - |
dc.date.issued | 2021-07-05 | - |
dc.date.submitted | 2021-03-19 | - |
dc.identifier.citation | LIMA, Cristiane Jeyce Gomes. Caracterização molecular pareada dos tumores primário e metastático de carcinoma diferenciado de tireoide refratário ao iodo radioativo. 2021. 97 f., il. Tese (Doutorado em Ciências da Saúde)—Universidade de Brasília, Brasília, 2021. | pt_BR |
dc.identifier.uri | https://repositorio.unb.br/handle/10482/41337 | - |
dc.description | Tese (Doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, 2021. | pt_BR |
dc.description.abstract | Introdução: O manejo do paciente com carcinoma diferenciado de tireoide (CDT)
refratário ao iodo é um desafio clínico. Em caso de progressão da doença,
desenvolvimento de resistência ao iodo radioativo e necessidade de terapia sistêmica, o
conhecimento do perfil molecular do tumor e do tecido metastático pode ser de grande
valia. Entretanto, ainda pouco se sabe e tem sido descrito sobre a análise combinada do
perfil molecular pareado do tumor primário de tireoide e de suas metástases, o padrão
de tendência dessas lesões compartilharem ou não as mesmas anormalidades genéticas
e o impacto clínico desse conhecimento na condução do paciente. Desta forma, entende-
se que o pareamento molecular de tumores primários e metastáticos do CDT pode
fornecer subsídios para o melhor conhecimento da patogênese envolvida no processo de
metastatização tumoral e, quando acessível e indicado, contribuir na decisão da terapia
alvo-específica mais apropriada a cada caso.
Objetivos: Esta pesquisa teve como objetivo analisar e correlacionar os dados clínicos,
histológicos e moleculares dos tecidos tumorais de indivíduos com CDT refratário ao iodo
radioativo, com foco na investigação e caracterização do perfil molecular pareado entre
os tumores primários e suas lesões metastáticas. Foi também objeto deste estudo
explorar o perfil de interação entre as proteínas codificadas pelos genes mutados
descritos nos tecidos tumorais dos pacientes dessa coorte com proteínas
fisiologicamente mais expressas na tireoide.
Metodologia: Neste estudo construiu-se uma coorte de 12 indivíduos adultos com
diagnóstico de CDT e metástases refratárias ao iodo radioativo, selecionados a partir de
uma amostragem de conveniência e em seguimento no MedStar Washington Hospital
Center ou no MedStar Georgetown University Hospital (Washington, DC – Estados
Unidos). As informações clínicas e histopatológicas desse grupo foram obtidas dos
prontuários eletrônicos. DNA e RNA foram extraídos do tumor primário e de sítios
metastáticos. As análises moleculares foram realizadas a partir do sequenciamento de
nova geração (NGS) utilizando-se um painel de 592 genes e da análise de fusões gênicas
por sequenciamento de RNA. Mutaçōes do promotor do gene TERT (telomerase reverse
transcriptase) foram investigadas por reação de polimerase em cadeia (PCR) digital
microfluidica. Variantes gênicas menos conhecidas foram analisadas com o uso da
ferramenta computacional PolyPhen-2 para predição do seu impacto funcional sobre as
respectivas proteínas codificadas. O perfil de imunogenicidade dos tumores foi avaliado
a partir da análise da expressão do PD-L1 (programmed cell death 1 ligand) por
imunohistoquímica e do estudo de dois biomarcadores, o teste de instabilidade de
microssatélites (MSI) e a carga de mutação tumoral (TMB). Análise de bioinformática
através do banco de dados STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting
Genes/Proteins) foi realizada com o objetivo de se investigar a existência de uma rede
de associações funcionais e estruturais proteína-proteína que possam estar envolvidas
na patogênese dos tumores da tireoide.
Resultados: Dos 12 participantes do estudo, dez eram do sexo masculino. A média de
idade do grupo ao diagnóstico de CDT foi de 6115,9 anos (variação, 25-82 anos). Nove
indivíduos apresentaram CDT papilar (PTC); um, CDT folicular (FTC); e dois, CDT de
célula Hürthle (CCH). A análise do panorama genético de todos os sítios emparelhados
incluiu o estudo dos genes BRAF, NRAS, HRAS, TP53, ATM, MUTYH, POLE e NTRK,
englobando as fusões nos genes BRAF e NTRK. BRAF V600E foi a mutação pontual
mais frequente entre os espécimes emparelhados dos pacientes (7/12). Destes sete
indivíduos, apenas um apresentou mutação de ponto BRAF não V600E (BRAF H542Y),
não descrita previamente em CDT, além de mutação no NRAS (p.Q61R) em tecidos
primário e metastático (ósseo). Este mesmo indivíduo, com tumor bastante agressivo e
metástases em diferentes tecidos, foi o único da coorte em que se detectou mutação do
promotor do TERT (p.C228T), no tecido metastático analisado. Uma fusão gênica ainda
não descrita na literatura foi encontrada em um paciente, BRAF-CEP152. As
anormalidades genéticas foram consistentes entre os sítios primário e metastático, com
discordância molecular encontrada em três indivíduos para mutações pontuais. A baixa
imunogenicidade do CDT desses pacientes foi evidenciada pelo perfil de estabilidade
encontrado no teste de MSI, pela TMB classificada como baixa a intermediária e pela
expressão PD-L1 ter permanecido positiva em apenas um paciente com CCH.
Conclusão: A análise pareada das anormalidades moleculares encontradas nos genes
driver dos tumores primários e sítios metastásticos dos indivíduos com CDT estudados
mostrou que apesar das mutações tenderem a ser concordantes, identificou-se três
indivíduos que apresentaram heterogeneidade molecular entre as lesões. O padrão de
expressão da PD-L1, da TMB e do MSI encontrados neste estudo corroboram o conceito
da baixa imunogenicidade do CDT, na maioria dos casos. Na exploração das
associações entre as proteínas codificadas pelos genes mutados descritos nas lesões
tumorais deste estudo com as proteínas fisiologicamente mais expressas na tireoide,
observou-se forte associação da proteína BRAF com as proteínas HRAS, NRAS e
NTRK1; e forte associação da proteína TP53 com as proteínas HRAS, NRAS, MUTYH e
ATM. Encontrou-se também uma conexão em rede das proteínas BRAF, HRAS, NRAS,
TP53, ATM com proteínas essenciais à fisiologia da tireoide, em especial com a proteína
PAX8. | pt_BR |
dc.language.iso | Português | pt_BR |
dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
dc.title | Caracterização molecular pareada dos tumores primário e metastático de carcinoma diferenciado de tireoide refratário ao iodo radioativo | pt_BR |
dc.type | Tese | pt_BR |
dc.subject.keyword | Tireóide - câncer | pt_BR |
dc.subject.keyword | Metástases | pt_BR |
dc.subject.keyword | Resistência ao iodo radioativo | pt_BR |
dc.subject.keyword | Pareamento molecular | pt_BR |
dc.subject.keyword | Sequenciamento de nova geração (NGS) | pt_BR |
dc.rights.license | A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data. | pt_BR |
dc.contributor.advisorco | Porto, Adriana Lofrano Alves | - |
dc.description.abstract1 | Background: The management of individuals with metastatic radioiodine-refractory
differentiated thyroid cancer (DTC) is a clinical challenge. In case of disease progression
with development of radioactive iodine resistance and need of systemic therapy, exploring
the paired genetic profile of primary tumor and its metastatic tissue may be a worthy tool.
Moreover, to the moment little is known and has been reported about the paired molecular
profile of the primary tumor and its metastases, their pattern and tendency of harboring
the same genetic abnormalities, and the clinical impact of this knowledge on the patient’s
management. So, the molecular pairing of DTC primary and metastatic lesions could
subside means for a better comprehension of some steps of the pathogenesis
mechanisms involved in tumor metastases and, when feasible and recommended,
assisting in the decision of the most appropriate target-specific therapy for each case.
Objectives: This research aimed to analyze and correlate clinical, histological and
molecular data from tumor tissues of individuals with radioactive iodine-refractory DTC,
focusing on the investigation and characterization of the paired molecular profile between
primary tumors and their metastasis. It was also the object of this study to explore the
association between the proteins coded by the mutated genes found in the tumor tissues
from the individuals in this cohort with proteins which are physiologically more expressed
in the thyroid gland.
Methodology: In this study we designed a cohort of 12 adult individuals diagnosed with
DTC and radioactive iodine-refractory metastasis, selected from a convenience sampling,
and being followed at MedStar Washington Hospital Center or MedStar Georgetown
University Hospital (Washington, DC - United States). Clinical and histopathological data
of this group were obtained from the electronic medical records. DNA and RNA were
extracted from the primary tumor and metastatic sites. Molecular analyses were
performed by next-generation sequencing (NGS) using a panel of 592 genes and gene
fusions were analyzed by RNA sequencing. Mutations of the TERT (telomerase reverse
transcriptase) gene promoter were investigated by microfluidic digital polymerase chain
reaction (PCR). Uncommon gene variants were analyzed using PolyPhen-2 software for
predicting the functional impact on the respective proteins. Protein expression of PD-L1
(programmed cell death 1 ligand) in paired tumor samples was determined by
immunohistochemistry. The biomarkers used for identification of the genomic signature of
the tumors were microsatellite instability (MSI) test and tumor mutation burden (TMB).
Bioinformatics analysis using the STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting
Genes/Proteins) database was performed in order to investigate the existence of a
functional and structural protein-protein associations network potentially related to the
pathogenesis of thyroid tumors.
Results: Out of the 12 participants, ten were male. The group mean age at diagnosis of
DTC was 61 ± 15.9 years (range, 25-82 years). Nine individuals had papillary DTC (PTC);
one, follicular DTC (FTC); and two, Hürthle cell DTC (HCC). The genetic landscape of all
paired sites included BRAF, NRAS, HRAS, TP53, ATM, MUTYH, POLE and NTRK genes,
including fusions in BRAF and NTRK genes. BRAF V600E was the most frequent point
mutation among the paired specimens (7/12). Out of those seven individuals, only one
harbored a BRAF non-V600E point mutation (BRAF H542Y), not previously described in
DTC, and also a mutation in NRAS (p.Q61R) in primary and metastatic (bone) tissues.
This same individual, who presented a very aggressive tumor and metastases in different
tissues, was the only one in the cohort in whom a mutation in the TERT promoter
(p.C228T) was detected in the analyzed metastatic tissue. A novel gene fusion was found
in one patient, BRAF-CEP152. Genetic abnormalities were consistent between primary
and metastatic sites, with molecular discordance found in three individuals for point
mutations. The low immunogenicity of DTC from these patients was evidenced by the
stability profile displayed by the MSI test, by the low to intermediate level of TMB, and by
PD-L1 expression positivity observed in only one patient with HCC.
Conclusion: Paired analysis of the molecular abnormalities found in the driver genes of
the primary tumors and metastatic sites of individuals with CDT in this cohort showed that
despite the mutations tended to be concordant, we identified three individuals who
showed molecular heterogeneity between lesions. The patterns of PD-L1 expression,
TMB and MSI testing displayed in this study corroborate the concept of low
immunogenicity of DTC, in most of the cases. In the exploratory assessment of the
associations between the proteins encoded by the mutated genes described in the tumor
lesions of this study and the mainly physiologically expressed proteins in the thyroid gland,
we observed a strong association between BRAF protein with HRAS, NRAS, and NTRK1
proteins; as well as a strong association between TP53 protein with HRAS, NRAS,
MUTYH, and ATM proteins. A network connection of BRAF, HRAS, NRAS, TP53, ATM
proteins with proteins which are essential for thyroid physiology, in particular with PAX8
protein, was also found. | pt_BR |
dc.contributor.email | cjlima@gmail.com | pt_BR |
dc.description.unidade | Faculdade de Ciências da Saúde (FS) | pt_BR |
dc.description.ppg | Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde | pt_BR |
Aparece nas coleções: | Teses, dissertações e produtos pós-doutorado
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