Perfil de virulência e filogenética de isolados clínicos de Escherichia coli resistentes a carbapenem recuperados em hospitais de Brasília-DF

Abstract

A espécie Escherichia coli tem o intestino de humanos, como habitat primário, vivendo em relação de comensalismo. Contudo, a aquisição de fatores de virulência por cepas especializadas, permite o estabelecimento de tipos patogênicos (patotipos) de E. coli. Patotipos de E. coli são agentes de infecção de uma série de sítios extraintestinais incluindo o trato urinário, corrente sanguínea e sistema nervoso central. A emergência de E. coli patogênica extraintestinal (ExPEC) portando genes de resistência a carbapenem blaKPC e blaNDM é temerária, sendo importante saber qual o potencial de virulência destas cepas de E. coli portando os genes blaKPC e blaNDM circulando no Distrito Federal. Isolados resistentes a carbapenem (carba-R) de E. coli mantidos pelo Laboratório Central de Saúde Pública (LACEN-DF) foram caracterizados em função de filogrupo e tipo de sequência e quanto a presença fatores de virulência (n=19) e de genes de resistência a carbapenens (n=5) e cefalosporinas (n=5). Foram analisadas 36 cepas isoladas de amostras de swab retal, urina, sangue, escara, líquido peritoneal e aspirado traqueal. A maioria dos isolados carba-R (58%) foi definida como de filogrupos comensais (A ou B1). Os fatores de virulência do patotipo ExPEC foram os mais detectados [Fyua (44, %), Foca (44, %), Yfcv (33, 3%), Vat (27,7 %) e Chua (25 %)]. O gene blaKPC foi detectado em maior frequência (52,7%) do que o gene blaNDM (36,1%) e de forma excludente. Entretanto, cepas positivas para KPC ou NDM acumularam blaIMP e genes de ESBL. Foram detectados 11 complexos clonais (CC) entre as cepas de E. coli carba-R, incluindo o CC de potencial epidêmico 131. No DF, isolados carba-R de E. coli circulam majoritariamente como cepas comensais (filogrupos A e B1) acumulando genes de resistência (blaKPC/NDM+blaCTX-M) e integram uma diversidade de grupos clonais.