Accelerating sensitivity analysis in microscopy image segmentation workflows with multi-level computation and data reuse

Abstract

Com a crescente disponibilidade de equipamentos de imagens microscópicas médicas existe uma demanda para execução eficiente de aplicações de processamento de imagens Whole Slide Tissue Images. Pelo processo de análise de sensibilidade é possível melhorar a qualidade dos resultados de tais aplicações, e subsequentemente, a qualidade da análise realizada a partir deles. Devido ao alto custo computacional e à natureza recorrente das tarefas executadas por métodos de análise de sensibilidade (i.e., reexecução de tarefas), emergem oportunidades para reuso computacional. Pela realização de reuso computacional otimiza-se o tempo de execução das aplicações de análise de sensibilidade. Este trabalho tem como objetivo encontrar novas maneiras de aproveitar as oportunidades de reuso computacional em múltiplos níveis de abstração das tarefas. Isto é feito pela apresentação de algoritmos de reuso de tarefas grão-grosso e de novos algoritmos de reuso de tarefas grão-fino, implementados no Region Templates Framework.