| Campo DC | Valor | Idioma |
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| dc.contributor.advisor | Nagata, Alice Kazuko Inoue | - |
| dc.contributor.author | Morais Júnior, Ivair José de | - |
| dc.date.accessioned | 2025-08-06T19:30:17Z | - |
| dc.date.available | 2025-08-06T19:30:17Z | - |
| dc.date.issued | 2025-08-06 | - |
| dc.date.submitted | 2024-08-27 | - |
| dc.identifier.citation | MORAIS JÚNIOR, Ivair José de. Explorando a diversidade genômica do potato virus Y e sua interação com o hospedeiro. 2024. 185 f., il. Tese (Doutorado em Fitopatologia) — Universidade de Brasília, Brasília, 2024. | pt_BR |
| dc.identifier.uri | http://repositorio.unb.br/handle/10482/52378 | - |
| dc.description | Tese (doutorado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2024. | pt_BR |
| dc.description.abstract | O potyvirus potato virus Y (PVY) já foi considerado um dos cinco vírus mais importantes
entre os vírus de plantas, devido à sua capacidade de infectar uma ampla gama de
hospedeiros, ser transmitido por várias espécies de afídeos e causar prejuízos
significativos em culturas de importância agronômica. Sua rápida adaptação a novos
ambientes, altas taxas de mutação e recombinação resultam em uma nuvem de mutantes
conhecida como vírus quasispecies, capazes de se adaptar a condições diversas
sobrevivendo no ambiente e se dispersando a novas regiões. Embora no passado alguns
programas de melhoramento tenham focado no desenvolvimento de materiais com
resistência à infecção por PVY, ainda existe uma grande lacuna de conhecimento sobre a
interação do vírus com diferentes hospedeiros e as alterações genômicas resultantes dessa
interação.
Para abordar essas questões, iniciamos a análise de isolados de PVY coletados em campos
de produção de tomate (PVYSl), batata (PVYSt) e pimentão (PVYCa). Desenvolvemos
um protocolo de sequenciamento genômico utilizando a tecnologia Nanopore de modo a
sequenciar simultaneamente os genomas de PVYCa, PVYSt e PVYSl, reduzindo
significativamente os custos operacionais. Essa abordagem foi capaz de trazer resultados
rápidos e comparáveis a abordagens como o sequenciamento Illumina. Foi também
realizada uma avaliação de resistência a infecção por PVY de cultivares de tomate,
pimentão e linhagens de Solanum spp. do Banco de Germoplasma do Instituto
Agronômico de Campinas. Observamos que nenhuma das cultivares de tomate, pimentão
e acessos de banco de germoplasma avaliados apresentou resistência à infecção por PVY,
indicando a necessidade urgente de busca por materiais com algum nível de resistência
para o mercado e para programas de melhoramento.
Para a análise da influência do hospedeiro nas modificações genômicas, um experimento
foi realizado com dois isolados virais (PVYNb, coletado em Nicotiana benthamiana, e
PVYSt) com 10 passagens virais sucessivas por inoculação mecânica em plantas de N.
benthamiana, tomateiro e batateira. PVYNb e PVYSt mostraram comportamentos
distintos: diminuição e extinção da infecção viral em tomateiro, aumento expressivo em
N. benthamiana e manutenção moderada em batateira. PVYNb apresentou maior
especialização com mais SNPs fixados, indicando maior capacidade adaptativa a novos ambientes e hospedeiros, enquanto PVYSt se mostrou mais generalista com menos SNPs
fixados. Além disso, investigamos a geração e manutenção de genomas defectivos virais
(GDVs) em diferentes populações de PVY. Foram identificados GDVs nas populações
de PVY, cuja produção foi dependente do isolado viral, modo de transmissão, órgão da
planta, passagem realizada e hospedeiro. Nossos achados fornecem informações para a
elaboração de novas abordagens de recomendações de manejo e controle do PVY,
promovendo avanços na sustentabilidade da produção agrícola. | pt_BR |
| dc.language.iso | eng | pt_BR |
| dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
| dc.title | Explorando a diversidade genômica do potato virus Y e sua interação com o hospedeiro | pt_BR |
| dc.title.alternative | Exploring the genomic complexity of potato virus Y and its interaction with hosts | pt_BR |
| dc.type | Tese | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Potyvirus | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Potato virus | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Sequenciamento genômico | pt_BR |
| dc.rights.license | A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data. | pt_BR |
| dc.contributor.advisorco | Fito, Santiago F. Elena | - |
| dc.description.abstract1 | The potyvirus potato virus Y (PVY) has been considered one of the five most important
plant viruses due to its ability to infect a wide range of hosts, be transmitted by various
aphid species, and cause significant damage to crops. Its rapid adaptation to new
environments, high mutation and recombination rates result in a cloud of mutants known
as viral quasispecies, capable of adapting to diverse conditions, surviving in the
environment, and spreading to new regions. Although some breeding programs in the past
focused on developing materials resistant to PVY infection, there remains a substantial
gap in knowledge about the virus' interaction with different hosts and the resulting
genomic alterations from this interaction.
To address these issues, we initiated the analysis of PVY isolates collected from tomato
(PVYSl), potato (PVYSt), and pepper (PVYCa) production fields. A genomic sequencing
protocol was developed using Nanopore technology so we could simultaneously
sequence the genomes of PVYCa, PVYSt, and PVYSl, significantly reducing operational
costs. This approach was able to bring fast results comparable to approaches such as
Illumina sequencing. We also evaluated the resistance to PVY infection of tomato and
pepper cultivars, and Solanum spp. lines from the Germplasm Bank of the Instituto
Agronômico de Campinas. None of the evaluated tomato, pepper cultivars, and
germplasm bank accessions showed resistance to PVY infection, indicating an urgent
need to find materials with some level of resistance for the market and breeding programs.
To analyze the host influence on genomic modifications, an experiment was conducted
with two viral isolates (PVYNb, collected from Nicotiana benthamiana, and PVYSt) with
10 successive viral passages through mechanical inoculation in N. benthamiana, tomato,
and potato plants. PVYNb and PVYSt exhibited different behaviors, displaying a
decrease and extinction of viral infection in tomato plants, a significant increase in N.
benthamiana, and moderate maintenance in potato plants. PVYNb showed greater
specialization with more fixed SNPs, indicating a higher adaptive capacity to new
environments and hosts, while PVYSt was more generalist with fewer fixed SNPs.
Additionally, we investigated the generation and maintenance of defective viral genomes
(DVGs) in different PVY populations. DVGs were identified in PVY populations, whose production depended on the viral isolate, transmission mode, plant organ, passage
performed, and host.
Our findings provide valuable information for developing new management and control
recommendations for PVY, promoting advances in the sustainability of agricultural
production. | pt_BR |
| dc.description.unidade | Instituto de Ciências Biológicas (IB) | pt_BR |
| dc.description.unidade | Departamento de Fitopatologia (IB FIT) | pt_BR |
| dc.description.ppg | Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia | pt_BR |
| Aparece nas coleções: | Teses, dissertações e produtos pós-doutorado
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