Identificação morfo-molecular de espécies de Pratylenchus em cana-de-açúcar no estado de São Paulo, Brasil

Abstract

A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma cultura agrícola fundamental no Brasil, especialmente no estado de São Paulo, principal produtor nacional. No entanto, fitonematoides como Pratylenchus,reduzem a produtividade ao causarem lesões radiculares. Este estudo aplicou taxonomia integrativa para identificar e mapear as espécies de Pratylenchus, em áreas de cultivo de cana-de-açúcar em São Paulo. Foram coletadas 33 amostras de solo e raízes em 23 municípios do estado. A identificação dos nematoides foi realizada por meio de análises morfológicas, morfométricas e moleculares. As variáveis morfométricas avaliadas incluíram: comprimento do corpo (L), comprimento do estilete (ST), diâmetro e altura dos bulbos do estilete (ØSTB e STB), comprimento da cauda (T), comprimento do esôfago (ESO), distância da vulva até o ânus (VA), diâmetros do corpo nas regiões anterior e da vulva (ØLAN e ØLVU), comprimento da sobreposição (EG), distância da extremidade anterior até a vulva (V), e relações métricas como a (L/maior largura do corpo), b (L/ESO), c (L/T) e V% ((V/L) × 100). Nas análises moleculares, foram utilizados primers espécie-específicos e o sequenciamento das regiões D2-D3 do rDNA 28S, 18S/26S do espaçador transcrito interno (ITS) e do gene mitocondrial citocromo oxidase I (COI). As análises revelaram a presença de duas espécies de Pratylenchus. Pratylenchus zeae, foi encontrado em todas as amostras, enquanto populações mistas com Pratylenchus brachyurus, foram observadas nos municípios de Guaianás, Itaí, Ituverava, Jales, Orlândia, Rancharia, Santo Antônio do Aracanguá e Santópolis do Aguapeí. A análise morfológica e morfométrica evidenciou diferenças significativas entre P. zeae e P. brachyurus, com os seguintes dados médios, respectivamente: L (509,9 µm; 607,2 µm), T (27,4 µm; 29,6 µm), ESO (85,5 µm; 110,8 µm), ST (15,2 µm; 18,3 µm), STB (2,3 µm; 3,20 µm), ØSTB (4,2 µm; 5,0 µm), VA (120,4 µm; 64,6 µm), ØLAN (21,3 µm; 24,1 µm), ØLVU (24,4 µm; 21,9 µm), V (363,9 µm; 515,0 µm), V% (71,4%; 84,8%), EG (30,1 µm; 43,8 µm), a (24,3; 25,2), b (6,0; 5,5) e c (18,7; 20,9), respectivamente. Além disso, a amplificação com primers específicos e a análise filogenética confirmaram a identificação das espécies. Este estudo reforça a importância das técnicas moleculares como complemento às metodologias clássicas, promovendo uma identificação precisa das espécies. Essa precisão é essencial para o desenvolvimento de estratégias de manejo integradas e eficazes, além de possibilitar a detecção precoce e o monitoramento de novas espécies que possam emergir na agricultura.