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| Data de publicação | Data de defesa | Título | Autor(es) | Orientador(es) | Coorientador(es) |
| 12-set-2017 | 22-jun-2017 | Ajuste automático de parâmetros para aplicações de segmentação nuclear em imagens médicas | Taveira, Luís Felipe Rabello | Teodoro, George Luiz Medeiros | - |
| 27-nov-2018 | 10-abr-2018 | Algoritmos genéticos para filogenia viva com matriz de características | Fernandes, Rafael Lins | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 15-mai-2016 | 9-set-2015 | Algoritmos paralelos exatos e otimizações para alinhamento de sequências biológicas longas em plataformas de alto desempenho | Sandes, Edans Flávius de Oliveira | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 30-mar-2023 | 25-ago-2022 | Análise de microRNAs em Arachis duranensis em resposta a condições de déficit hídrico e infecção por Meloidogyne arenaria | Corrêa, Matheus de Paula | Miller, Robert Neil Gerard | Grynberg, Priscila |
| 18-jul-2014 | 19-mar-2014 | Análise genômica de Mycobacterium massiliense GO 06 | Ribeiro, Guilherme Menegói | Brígido, Marcelo de Macedo | Alencar, Tainá Raiol |
| 17-jun-2024 | 28-jun-2023 | Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos | Mesquita, Felipe de Araújo | Souza, Marlene Teixeira de | Silva, Waldeyr Mendes Cordeiro da |
| 20-ago-2024 | 26-abr-2024 | Análise in sílico e produção da apirase recombinante de Rhodnius Prolixus | Moura, Renan Pereira | Santana, Jaime Martins de | - |
| 5-jan-2018 | 6-jul-2017 | Uma arquitetura baseada em containers para workflows de bioinformática em nuvens federadas | Alves, Tiago Henrique Costa Rodrigues | Araújo, Aletéia Patrícia Favacho de | - |
| 20-jun-2017 | 23-fev-2017 | Arquitetura de um controlador de elasticidade para nuvens federadas | Vergara, Guilherme Fay | Araújo, Aletéia Patrícia Favacho de | - |
| mai-2008 | mai-2008 | Arquiteturas em FPGA para comparação de sequências biológicas em espaço linear | Corrêa, Jan Mendonça | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 3-jan-2023 | 2022 | Avaliação da importância ecológica e biotecnológica de 10 MAGs do filo Latescibacterota recuperados do microbioma de esponjas do recife Amazonas | Oliveira, Rafael da Silva | Krüger, Ricardo Henrique | - |
| 17-mar-2025 | 16-dez-2024 | Biogeografia do Arqueoma Oral | Cena, Jessica Alves de | Teixeira, Nailê Damé | Belmok, Aline |
| 7-fev-2013 | 22-jun-2012 | BioNimbus : uma arquitetura de federação de nuvens computacionais híbrida para a execução de workflows de Bioinformática | Saldanha, Hugo Vasconcelos | Walter, Maria Emília Machado Telles | Araújo, Aletéia Patrícia F. |
| 1-jul-2024 | 30-out-2023 | Bioprospecção da microbiota intestinal de Synthermes wheeleri utilizando o metagenoma bacteriano para minerar enzimas capazes de converter lignocelulose em químicos com alto valor agregado | Lima, Raul Alcântara Teixeira | Krüger, Ricardo Henrique | - |
| 12-jul-2024 | 2023 | Caracterização in silico e avaliação da atividade anti-hemostática do antígeno 5 da saliva de Rhodnius neglectus, vetor da doença de Chagas | Vieira, Giulia Causin | Araújo, Carla Nunes de | Santiago, Paula Beatriz de Medeiros |
| 26-jul-2021 | 5-mar-2021 | Comparação paralela de sequências biológicas em múltiplas GPUs com descarte de blocos e estratégias de distribuição de carga | Figueirêdo Júnior, Marco Antônio Caldas de | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 16-nov-2009 | 20-mar-2006 | Comparação paralela exata de seqüências biológicas longas com uso limitado de memória | Batista, Rodolfo Bezerra | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 15-abr-2011 | 23-set-2010 | Escalonamento de tarefas no ambiente do Peer-to-peer do BIOFOCO III | Tedesque, José Carlos | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 19-jan-2011 | 25-out-2010 | Estratégia distribuída híbrida em cluster multicore heterogêneo para alinhamento múltiplo de sequencias biológicas com o dialign-tx | Macedo, Emerson de Araújo | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | Pfischer, Gerson Henrique |
| 12-abr-2016 | 29-jan-2016 | Execução eficiente do padrão de propagação de ondas irregulares na arquitetura Many Integrated Core | Gomes, Jeremias Moreira | Teodoro, George Luiz Medeiros | - |
